AutoDock ist eine Docking Software, die unter der GNU GPL Lizenz frei verfügbar ist und damit eine weiter Verbreitung, vor allem in akademischen Kreisen, gefunden hat. Über einen genetischen Algorithmus werden Moleküle in einem vorberechneten Energieraster platziert, welches die Bindetasche eines Targetproteins repräsentiert.

ViSoR vereinfacht die Verwendung von AutoDock, indem der gesamte Ablauf des Screenings über die ViSoR Benutzeroberfläche gesteuert wird. Die in ViSoR verwalteten Molekülstrukturen werden für ein Screening ausgewählt. Nach Angabe von wenigen zusätzlichen Informationen zur Beschreibung der Bindetasche und zur genauen Durchführung des Dockings, kann das Screening direkt aus ViSoR heraus angestoßen und parallel auf dem angeschlossenen Rechensystem ausgeführt werden.

Der Anwender muss sich nicht mit den AutoDock-eigenen Datenformaten und Instalaltions-Details auseinandersetzen. Das Ergebnis des Screenings wird automatisch prozessiert und in ViSoR in Form einer Tabelle verfügbar gemacht. Die Tabelle kann mit allen zur Verfügung stehenden Methoden bearbeitet und analysiert werden.