Im zweiten Schritt unterstützt KITcontrol die Entwicklung neuer Kits. Durch die einfache Überprüfung von in Entwicklung befindlicher Sequenzen mit Treffern aus der NCBI Datenbanken, kann frühzeitig sichergestellt werden das sämtliche Erregervarianten erkannt werden.

Eine aufgabenbezogene Aufbereitung der Sequenzen und Alignments, sowie eine grafische Aufbereitung der Alignments werden mit dem Schwerpunkt des Qualitätsmanagements von der Anwendung KITcontrol ausgeführt. Zur besseren Auffindbarkeit von Mismatches erstellt KITcontrol eine farbige und übersichtliche Darstellung des Alignments mehrerer Sequenzen.

Mit dem Arbeitsplatz KITcontrol ist eine HTML5 Oberfläche entstanden, die grafische Darstellung ist intuitiv bedienbar. Eine individuelle Anbindung an bestehende IT-Landschaften kann unkompliziert realisiert werden. KITcontrol besitzt Schnittstellen zu den praxiserprobten Open-Source Programmen wie BLAST, CLUSTAL und PRIMER3 und ist somit eine kosteneffiziente Anwendung.
Eine umfangreiche Benutzerverwaltung mit verschiedenen Benutzerrollen unterstützt die Teamarbeit.